2012年由邱蔚六院士及夫人王晓仪教授首批捐款100万元设立的“邱蔚六口腔颌面外科发展基金”正式立项，此项发展基金是为了促进口腔颌面外科医学事业的发展，铭记为口腔颌面外科事业做出杰出贡献的先驱者以及扶持和鼓励后来者奋发向上，继往开来。首批获奖者已于2012年9月举办的第七次中国国际暨第十次全国口腔颌面外科学术会议上授予证书和奖金。第二届于2014年8月在西安召开的第十一届亚洲口腔颌面外科学术大会期间产生获奖者并在大会上授予证书和奖金。经2016年对基金实施细则的修订，对奖项的设置及评选做了调整。奖项设置上在“华佗奖”、“杰出贡献奖”和“曙光奖”三个奖项的基础上增设“希望奖”，以英文竞赛的形式表彰优秀的口外青年医师，奖项名额上也做相应增加，扩大获奖人次。暂停原先“青年医师培训基金”（出国基金），做到将有限的资金尽可能的惠及到更广的受众面。用具有永久纪念意义的特制奖牌及证书取代之前的奖金。现设四个奖项：华佗奖、杰出贡献奖、曙光奖，及希望奖，第三届已于2016年10月在沈阳召开的第十三次口腔颌面外科学术大会期间产生获奖者并在大会上授予证书和奖金。2018年10月在重庆举行第十四次全国口腔颌面外科学术会议期间颁发了第四届“邱蔚六口腔颌面外科发展基金”各项奖项。